Bên cạnh việc tổ chức tốt các hoạt động giáo dục, giảng dạy, Trường đã luôn quan tâm đến việc tổ chức các hoạt động thể dục – thể thao (TDTT). Vì vậy phong trào TDTT trong những năm vừa qua được duy trì thường xuyên với sự tham gia đông đảo của thầy và trò Trường Tiểu học Bàu Sen.
Theo đó, hàng năm nhà trường đều duy trì tốt việc tổ chức Hội khoẻ Phù Đổng (HKPĐ) cấp trường với các bộ môn: đá cầu, cờ tướng, bóng rổ, bóng ném. Từ đó chọn ra những vận động viên đại diện cho trường tham gia HKPĐ cấp Quận và cấp thành phố.
