Thực hiện Đề án “Bảo đảm dinh dưỡng hợp lý và tăng cường hoạt động thể lực cho trẻ em, học sinh, sinh viên để nâng cao sức khỏe, dự phòng bệnh ung thư, tim mạch, đái tháo đường, bệnh phổi tắc nghẽn mạn tính và hen phế quản giai đoạn 2018-2025"; trường Tiểu học Bàu Sen thường xuyên tổ chức các hoạt động nâng cao sức khỏe cho các em học sinh thông qua giờ sinh hoạt tại lớp cũng như tập thể dục gữa giờ.